La estructura organizacional de ALAFEC se ajusta a la geografía de América Latina. Actualmente la Asociación se encuentra distribuida en las siguientes cuatro regiones geográficas:
La estructura organizacional de la Asociación, pretende responder a las necesidades y retos que se ha planteado ALAFEC. Actualmente es la siguiente:
La Asamblea General, es el órgano supremo de la Asociación y se reúne con carácter de ordinario cada dos años. Está integrada por los Directores, Decanos o delegados debidamente acreditados de las Instituciones de Educación Superior que imparten la carrera de Contaduría en Latinoamérica.
De esta Asamblea se desprenden los siguientes órganos y representantes: